De drukeenheid vangestapelde flexodrukmachinewordt op en neer gestapeld, gerangschikt aan een of beide zijden van het hoofdwandpaneel van de afgedrukte delen, elke drukkleurgroep wordt aangedreven door tandwielen die op het hoofdwandpaneel zijn gemonteerd. Bij het afdrukken passeert het substraat achtereenvolgens elke afdrukkleureenheid. Voltooi alle afdrukken. Elke drukkleurgroep heeft een afdrukcilinder, plaatcilinder en inktapparaat. De structuur van elke drukkleurgroep is hetzelfde. De gestapelde flexografische drukmachine kan 1-8 kleuren afdrukken, maar meestal 6 kleuren. Indien uitgerust met een omkeerinrichting, kan deze ook dubbelzijdig printen.